Hallo Hannes und super das du dir die Mühe machst!
Meine Recherchen haben soweit ergen, das es sich bei den 39T01 und 40T01 möglicherweise um PALs oder GALs handelt.
Wäre zwar auf der einen Seite schade, weil nicht ersetzbar, aber auf der anderen Seite auch nicht so schlimm, weil ich dort keinen Fehler vermute.
Ich hab mir die Schaltung rund um die Main Relay Steuerung noch mal angesehen. Folgendes ist mir dabei aufgefallen:
Das Gate des MOSFET wird von 3 smd Transistoren angesteuert, während es mit 20kOhm gegen Masse geschaltet ist. Das bedeutet, das ein Leckstrom eigentlich unwahrscheinlich ist.
Der unterste der 3 smd Transistoren scheint eine Kurzschlusssicherung zu sein. Über den grauen Lastwiderstand (2 Ohm) fliesst der Strom für das Main Relais. Wird der Strom zu gross, fällt über dem Widerstand eine Spannung ab und bei 0,7V (350mA) schaltet der smd Transitor das Gate gegen Source kurz.
Die beiden anderen smd Transistoren scheinen eine art oder-Verknüpfung zu bilden. Wo die ihr Signal her bekommen, muss ich erst noch durchpiepsen.
Soweit erst mal... 
VG
Ralf