Die Stopfen (aus Gummi) würde ich vorm Schweißen erstmal entfernen. 
Markiertes Blech (Pfeil) ist der Boden des Seitenkastens. Den nur etwas hochbiegen (das sieht so noch gut aus).
Reihenfolge: von innen nach außen
.... Natürlich vorher alle Bleche anpassen/vorbereiten und Position markanter Kanten für Spaltmaße (korrekten Scheibenrahmen, Türrahmen...), Muttern für Halterungen (Hilfsrahmenaufnahme, Türscharniere, Haube, etc) markieren/ausrichten. Viele und richtige Gripzangen helfen enorm.
Ich würde mit dem Innenschweller beginnen.
Die Front würde ich zum Ende (mit der meisten Übung ;)) am Windleitblech und den Stehwänden (A-Säule) beginnen.
Beispiel (etwas in der Mitte kommen Bilder mit meiner Blecharbeit ;))